7 июля 1941 года первые танки противника вошли в город Бердичев, а уже на следующий день город был полностью оккупирован. Эвакуации жителей, даже частичной, проведено не было по причине того, что сводка Информбюро о расположении и движении немецких войск отставала от реальности. Город просто был не готов к появлению врага.
Лагерь смерти, который во время оккупации располагался на территории города, забрал 38536 жизней женщин, детей и стариков. Около 12 тысяч человек было вывезено на каторжные работы на территорию Германии.
Все подпольные группы, действовавшие в этом районе, в 1942-43 годах были арестованы и убиты. В ходе войны в городе было уничтожено или значительно повреждено более 45% жилого фонда.
Бердичев был освобожден войсками 1-го Белорусского фронта 5 января 1944 года.